Откритите в близост до село Чупрене съдове от глина са едно от първите доказателства, че по тези места има наличие на човешки живот от дълбока древност. Бронзовата и желязната са двете епохи, към които са датирани намерените находки. Те са предимно в пещери до още едно близко село, известно като Търговище. Но планинският проход Свети Никола допринася още повече за това да има богати находки от една друга знакова за човечеството епоха – времето на Римската империя. Могат и до днес да се видят входовете на различните галерии, в които има залежи от медна руда. Купрум е другото име на тази руда, с която името на селото се свързва напълно основателно. За да се сдобие обаче с днешното наименование, населеното място преминава през различни етапи и тогава имената му са разнообразни. Древните крепости се виждат там под формата на останки. За тях се предполага, че са оставени от римските войници постове със сигнална цел.
През 1455-та година Чупрене официално фигурира в турските регистри, а саксонските рудари се заселват по тези места точно по това време. При избухването на първото в историята на България въстание през 1688-ма година в Чипровци, жителите на селото се включват активно в борбата. През 1841-ва година един от световно известните учени на 19-ти век прави пътуване за Ниш и на път за сръбския град минава през Белоградчик. Тогава той в пътеписа си споменава селото, само че то е записано като Чупрен. Името на изследователя е Жером Бланки, а годините след освобождението на страната от турско робство се оказват благоприятни за селото. Тогава неговото население със сравнително бързи темпове нараства до около 2 000 души. Двете световни войни се оказват пагубни за селото най-вече от гледна точка на това, че има много паднали мъже в борбите. А след 1944-та се наблюдава подем в развитието на някои отрасли, като например отглеждането на домашни свите и добив на дървета. Едрият рогат добитък също се отглежда доста добре в селото, а паралелно с това се развива и промишлеността за добив на текстил. Българските жители в селото се самоопределят като торлаци и са около 83 процента.
На събора в село Чупрене по традиция идват много гости и има музика и забавление. Часовникът в центъра на селото и музеят Асен Балкански се явяват две от основните местни забележителности. Всъщност часовникът е на голяма камбанария, а в края на селото в посока запад може да се забележи паметна плоча. Тя е посветена на учредяването на местната комунистическа организация. Съборът е през месец май, а горският празник се провежда в началото на август. По време на ловния сезон в гората има доста ловни дружинки. От десети юли до десети август всяка година в селото има и местен общински футболен турнир. За развитието на туризма е приет план през 2012-та година, като при връх Миджур се планира създаването на писта за ски. Планират се общо 14 ски писти, като към 2017-та проектът е официално одобрен. Лифтовете и помощните постройки също влизат като съоражения от този проект.
